### R code from vignette source 'effects.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: effects.Rnw:5-6 ################################################### options(show.signif.stars=FALSE,digits=4,width=70) ################################################### ### code chunk number 2: effects.Rnw:10-16 ################################################### load(url("http://www.stat.umn.edu/~sandy/courses/8053/Data/Achiv.Rda")) meanses <- with(Achiv, tapply(ses, school, mean)) head(meanses) length(meanses) Achiv$meanses <- meanses[as.character(Achiv$school)] Achiv$indivses <- with(Achiv, ses - meanses) ################################################### ### code chunk number 3: effects.Rnw:19-24 ################################################### library(effects) library(lme4) m5 <- lmer(mathach ~ indivses*sector + indivses*meanses + (indivses | school), data=Achiv) print(m5, corr=FALSE) ################################################### ### code chunk number 4: eff1 ################################################### print(plot(effect("sector", m5) )) ################################################### ### code chunk number 5: eff2 ################################################### print(plot(effect("indivses*sector", m5))) ################################################### ### code chunk number 6: eff3 ################################################### print(plot(effect("indivses:meanses", m5))) ################################################### ### code chunk number 7: eff4 ################################################### print(plot(effect("indivses:sector:meanses", m5), factor.names=FALSE))